30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4084 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  347  5e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  98.8 
 
 
167 aa  342  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  98.8 
 
 
167 aa  342  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  98.2 
 
 
167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  89.22 
 
 
167 aa  316  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  86.23 
 
 
167 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  86.23 
 
 
167 aa  307  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  86.23 
 
 
167 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  83.23 
 
 
167 aa  294  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  66.06 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  67.88 
 
 
171 aa  231  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  64.85 
 
 
167 aa  229  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  64.74 
 
 
163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 
504 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
663 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 
656 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 
656 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  41.55 
 
 
643 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  38.85 
 
 
622 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  36.84 
 
 
543 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 
515 aa  95.1  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 
620 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  28.23 
 
 
620 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 
602 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 
582 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 
572 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
458 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 
485 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.96 
 
 
475 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
222 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>