21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6893 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6893  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 386 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 394 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  31.34 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 394 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 402 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 376 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 462 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 468 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  30.43 
 
 		 456 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 475 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 471 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  31.62 
 
 		 479 aa  43.5  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 663 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 402 aa  41.6  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>