38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0344 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  30 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  32.8 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 
430 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
334 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 
391 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  28.89 
 
 
382 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 
471 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 
480 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.18 
 
 
385 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 
480 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 
138 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  27.33 
 
 
555 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 
402 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  28.79 
 
 
473 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 
498 aa  45.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 
412 aa  45.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  24.09 
 
 
1672 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  28.43 
 
 
207 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 
485 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 
1687 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 
602 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  29.77 
 
 
764 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
413 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  25.97 
 
 
778 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1646  AAA-4 family protein  25.56 
 
 
770 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 
492 aa  42.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 
469 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25 
 
 
494 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>