28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3194 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  487  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  43.75 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  32.69 
 
 
264 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  36.36 
 
 
341 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  41.42 
 
 
221 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  35.83 
 
 
271 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  112  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  33.99 
 
 
196 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  33.71 
 
 
206 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  34.71 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  32.08 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  32.95 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  35.85 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  26.06 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  27.57 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  26.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  26.67 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  31.65 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  36.23 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  28.31 
 
 
439 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1787  hypothetical protein  31.36 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  26.54 
 
 
215 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  34.48 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4547  hypothetical protein  26.72 
 
 
172 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.214497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1684  hypothetical protein  23.46 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  28.28 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1511  hypothetical protein  26.92 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>