14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1787 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1787  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  54.55 
 
 
221 aa  140  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  40.71 
 
 
217 aa  97.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  36.69 
 
 
237 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  34.23 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  34.09 
 
 
196 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  34.38 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  34.09 
 
 
241 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  35.48 
 
 
271 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  29.66 
 
 
202 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  23.74 
 
 
382 aa  58.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  30.53 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  30.3 
 
 
206 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  25.5 
 
 
426 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>