30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0660 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  50.73 
 
 
219 aa  197  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  46.19 
 
 
219 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  45.41 
 
 
439 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  45.89 
 
 
436 aa  181  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  47.47 
 
 
426 aa  178  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  45.41 
 
 
224 aa  169  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1684  hypothetical protein  42.5 
 
 
204 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4547  hypothetical protein  42.76 
 
 
172 aa  128  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.214497  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4523  hypothetical protein  32.12 
 
 
213 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3230  hypothetical protein  35.75 
 
 
189 aa  111  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4150  hypothetical protein  30.3 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3406  hypothetical protein  30.32 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.724909  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4349  hypothetical protein  29.53 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.197254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  30.86 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  30.94 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  26.15 
 
 
204 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  24.75 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  26.38 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  30.53 
 
 
271 aa  55.1  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  24.87 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0119  hypothetical protein  39.5 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.662121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  26.54 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  27.53 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  24.03 
 
 
341 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  26.23 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  25.67 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  29.41 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  28.28 
 
 
196 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  32.71 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>