28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2379 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  39.31 
 
 
204 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  27.46 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  29.03 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  28.73 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  27.68 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  32.74 
 
 
439 aa  67  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  26.07 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  65.5  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  31.47 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  25.52 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  32.68 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  31.45 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  29.27 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  22.71 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1684  hypothetical protein  30.61 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  20.42 
 
 
341 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  31.51 
 
 
183 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  26.32 
 
 
426 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  19.51 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4523  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  28.08 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4547  hypothetical protein  26.97 
 
 
172 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.214497  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2455  hypothetical protein  22.78 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10691 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1864  hypothetical protein  27.64 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3687  hypothetical protein  30.77 
 
 
211 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>