20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1696 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  96.12 
 
 
206 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  32.24 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  28.16 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  34.71 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  28.72 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  27.41 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  30.89 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  34.23 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  25.47 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  27.33 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  27.47 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  27.71 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  32.35 
 
 
271 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  27.67 
 
 
436 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  25.57 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  26.79 
 
 
439 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  27.53 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  23.17 
 
 
224 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  24.08 
 
 
426 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>