21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3198 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  52.17 
 
 
341 aa  255  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  46.46 
 
 
271 aa  229  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  30.47 
 
 
221 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  32.69 
 
 
241 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  26.56 
 
 
237 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  25.91 
 
 
217 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  25.43 
 
 
196 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  27.95 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  28.37 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  29.28 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  26.74 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  26.44 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  24.2 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1787  hypothetical protein  34.34 
 
 
157 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  21.91 
 
 
426 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  19.42 
 
 
439 aa  45.8  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  21.88 
 
 
436 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  23.04 
 
 
219 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  27.1 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  21.95 
 
 
219 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>