24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1992 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  544  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  58.17 
 
 
341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  47.13 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  30.65 
 
 
217 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  30.74 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  34.52 
 
 
241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  34.17 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  29.71 
 
 
196 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  28.21 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  22.35 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  26.11 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  28.15 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  23.26 
 
 
221 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  52.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  30.81 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  29.91 
 
 
195 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  28.48 
 
 
436 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  25.13 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  29.63 
 
 
219 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  25.77 
 
 
426 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  25.99 
 
 
439 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1787  hypothetical protein  36.25 
 
 
157 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>