24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0374 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  93.99 
 
 
195 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0469  hypothetical protein  30.95 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1511  hypothetical protein  27.54 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  31.35 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  31.2 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  32.59 
 
 
219 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  32.28 
 
 
439 aa  54.7  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  30.07 
 
 
436 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  31.15 
 
 
237 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  31.03 
 
 
271 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  32.06 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  30.47 
 
 
224 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  30.37 
 
 
219 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  31.06 
 
 
426 aa  51.6  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  31.03 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  28.78 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  27.07 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  24.66 
 
 
202 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  29.41 
 
 
215 aa  45.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  32.46 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  27.88 
 
 
341 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3230  hypothetical protein  23.13 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  30.95 
 
 
264 aa  41.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>