29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1515 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  42.86 
 
 
217 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  41.51 
 
 
237 aa  161  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  31.8 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1787  hypothetical protein  53.33 
 
 
157 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  41.42 
 
 
241 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  34.01 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  30.58 
 
 
341 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  38.31 
 
 
196 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  29.11 
 
 
382 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  31.46 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  32.91 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2454  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.116134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  30.68 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0356  hypothetical protein  32.45 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  29.71 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  28.82 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  27.71 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  26.88 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0374  hypothetical protein  31.35 
 
 
183 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  26.77 
 
 
439 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  27.84 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  26.6 
 
 
436 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  24.75 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1684  hypothetical protein  24.32 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4523  hypothetical protein  28.44 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4547  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.214497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3230  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>