28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0449 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  78.26 
 
 		 167 aa  268  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  78.26 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  71.61 
 
 		 167 aa  238  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  70.97 
 
 		 167 aa  235  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  70.32 
 
 		 167 aa  234  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  68.48 
 
 		 167 aa  234  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  67.88 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  67.88 
 
 		 167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  67.88 
 
 		 167 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 		 167 aa  230  6e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  69.59 
 
 		 163 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  68.39 
 
 		 167 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  43.97 
 
 		 643 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 663 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 656 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  39.04 
 
 		 656 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 504 aa  110  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  39.86 
 
 		 622 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  40 
 
 		 543 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 515 aa  90.5  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 602 aa  62  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 582 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  24.82 
 
 		 620 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  24.82 
 
 		 620 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 572 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  24.46 
 
 		 475 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 458 aa  40.8  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>