94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3790 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 402 aa  829    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.11 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.97 
 
 		 406 aa  308  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.42 
 
 		 397 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.07 
 
 		 406 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.9 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.99 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.51 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.85 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.4 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.35 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.82 
 
 		 397 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.23 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.34 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  39.59 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  35.98 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3358  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.47 
 
 		 413 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1372  fic family protein  37.31 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.65 
 
 		 413 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  36.03 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  37 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  33.51 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.25 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.91 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.84 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  40.36 
 
 		 224 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.44 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.15 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  25.15 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  25.15 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.74 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.32 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.49 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.1 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0317  hypothetical protein  38 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0608446  normal  0.0902028 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.94 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.2 
 
 		 222 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.53 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.75 
 
 		 508 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  24.92 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3516  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.28 
 
 		 207 aa  53.5  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.438285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.68 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.55 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.73 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  25.13 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.19 
 
 		 317 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.44 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  23.44 
 
 		 358 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.62 
 
 		 243 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.14 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.89 
 
 		 531 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.87 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0601  hypothetical protein  30.17 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.42 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  37.18 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1233  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 248 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.34 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.32 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.89 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2613  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.92 
 
 		 248 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.12 
 
 		 245 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.44 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  34.02 
 
 		 394 aa  46.6  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  25 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.09 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.11 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04073  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.71 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.63 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  25 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.32 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  21.12 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.34 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.46 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.11 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.59 
 
 		 541 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.21 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0061  fic family protein  24.66 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.99 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.78 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.71 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  24.02 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.41 
 
 		 253 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  27.83 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.94 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  25.48 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.93 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.76 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.76 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.12 
 
 		 533 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  20.09 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>