235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1899 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 511 aa  1054    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.8 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  49.49 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.27 
 
 		 507 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.25 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.04 
 
 		 505 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.21 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 512 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.27 
 
 		 502 aa  236  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.7 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  30.54 
 
 		 503 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.24 
 
 		 564 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.54 
 
 		 537 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.22 
 
 		 514 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 536 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.83 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  25.99 
 
 		 519 aa  156  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.25 
 
 		 555 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  27.45 
 
 		 537 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.95 
 
 		 508 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.77 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  24.28 
 
 		 512 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.9 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  37.14 
 
 		 429 aa  88.6  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.79 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.4 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.94 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  36.52 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.4 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.14 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  36 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.06 
 
 		 384 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.31 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.76 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.26 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  34.23 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  33.04 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 393 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  35.14 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.5 
 
 		 387 aa  66.6  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.7 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.23 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  34.23 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.23 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.97 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  33.04 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.96 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.47 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  27.39 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  27.39 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.91 
 
 		 531 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.51 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.29 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0191  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  37.07 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.32 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.03 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.92 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.76 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.76 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  31.36 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  34.29 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.11 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.74 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.2 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.15 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.04 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.37 
 
 		 358 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  28.32 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  30.17 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.67 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.71 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 371 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.65 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2726  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.26 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.57 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.87 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  27.74 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  35.29 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.65 
 
 		 370 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.73 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.78 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.57 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  35.29 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1049  Fic family protein  27.74 
 
 		 271 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000030649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0835  fic family protein  33.04 
 
 		 386 aa  54.3  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>