49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2644 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  726    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1351 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1030 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 850 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1750 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 892 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.97 
 
 		 2831 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 963 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1026 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 772 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1051 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  31.19 
 
 		 2961 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.12 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.11 
 
 		 1292 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.23 
 
 		 1130 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.39 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.81 
 
 		 2296 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1763 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 		 863 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 		 770 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.76 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 756 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.88 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 807 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 1046 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3599  hypothetical protein  27.69 
 
 		 694 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.161985  decreased coverage  0.00880556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.88 
 
 		 930 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  25.41 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.84 
 
 		 719 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  26.06 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  22.84 
 
 		 676 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.31 
 
 		 588 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1146 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1163 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.22 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 		 504 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.08 
 
 		 2350 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.02 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  25.91 
 
 		 841 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  30.97 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3565  hypothetical protein  26.29 
 
 		 791 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.79 
 
 		 752 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.94 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  25.11 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  27.98 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.23 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.59 
 
 		 668 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>