More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2874 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
604 aa  1175    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  52.96 
 
 
638 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  58.74 
 
 
541 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  62.5 
 
 
548 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  62.41 
 
 
594 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  64.07 
 
 
694 aa  342  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  60.53 
 
 
514 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  60.71 
 
 
508 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  57.84 
 
 
589 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  53.23 
 
 
637 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.81 
 
 
585 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  47.15 
 
 
771 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.63 
 
 
644 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
586 aa  247  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.79 
 
 
599 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  49.81 
 
 
716 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  47.18 
 
 
721 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
820 aa  244  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  53.31 
 
 
573 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  50.34 
 
 
646 aa  243  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  49.13 
 
 
608 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  45.73 
 
 
547 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
612 aa  240  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.29 
 
 
751 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  48.48 
 
 
613 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  48.3 
 
 
542 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.51 
 
 
569 aa  237  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  47.72 
 
 
624 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.06 
 
 
932 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  48.46 
 
 
535 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  50.38 
 
 
637 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 
560 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  45.72 
 
 
528 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  50 
 
 
557 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 
569 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  50.75 
 
 
520 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  49.62 
 
 
742 aa  231  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 
680 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.62 
 
 
898 aa  229  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.6 
 
 
421 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.56 
 
 
624 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  48.55 
 
 
641 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  49.43 
 
 
806 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
617 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50 
 
 
1256 aa  228  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 
652 aa  227  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.03 
 
 
716 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.82 
 
 
687 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  52.27 
 
 
597 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  47.6 
 
 
572 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.5 
 
 
835 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  46.77 
 
 
870 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  48 
 
 
587 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
542 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  40.06 
 
 
455 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 
555 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  52.29 
 
 
520 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
734 aa  223  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 
571 aa  223  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 
481 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  50.76 
 
 
544 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.53 
 
 
608 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.76 
 
 
828 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  51.95 
 
 
676 aa  220  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.34 
 
 
618 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  48.03 
 
 
611 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.78 
 
 
496 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  49.07 
 
 
551 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  52.16 
 
 
780 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
738 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.82 
 
 
814 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  48.97 
 
 
632 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
360 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
870 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 
292 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  47.45 
 
 
564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.97 
 
 
481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.11 
 
 
600 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  47.21 
 
 
623 aa  213  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.8 
 
 
603 aa  213  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  48.51 
 
 
526 aa  213  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  46.01 
 
 
630 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
624 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.29 
 
 
729 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  51.32 
 
 
865 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 
644 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  45.38 
 
 
695 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
550 aa  210  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.62 
 
 
833 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 
522 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  41.75 
 
 
564 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.59 
 
 
733 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  49.41 
 
 
616 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 
601 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8116  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.06 
 
 
654 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4722  serine/threonine protein kinase  47.49 
 
 
749 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.23 
 
 
1148 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.63 
 
 
1194 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  45.7 
 
 
416 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>