More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2375 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2375  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
651 aa  1286    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  51.91 
 
 
738 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  49.5 
 
 
608 aa  283  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  55.73 
 
 
637 aa  280  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  56.9 
 
 
632 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  49.07 
 
 
542 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.38 
 
 
932 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.13 
 
 
835 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3842  serine/threonine protein kinase  41.99 
 
 
357 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.276356  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 
608 aa  225  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  47.04 
 
 
586 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  46.79 
 
 
624 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 
734 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
560 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  45.35 
 
 
612 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  47.22 
 
 
680 aa  217  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  45.17 
 
 
589 aa  217  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  47.64 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  46.92 
 
 
716 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.82 
 
 
729 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  44.87 
 
 
613 aa  214  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 
547 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 
569 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1298  serine/threonine protein kinase  50.85 
 
 
520 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
292 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
694 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  43.17 
 
 
721 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
421 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0024  serine/threonine protein kinase  41.19 
 
 
572 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
541 aa  210  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
535 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  46.92 
 
 
806 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  44.24 
 
 
637 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 
481 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.74 
 
 
587 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 
555 aa  206  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  47.39 
 
 
620 aa  207  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.13 
 
 
618 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  46.82 
 
 
544 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.52 
 
 
641 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40 
 
 
644 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  44.61 
 
 
551 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
624 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
820 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  43.23 
 
 
573 aa  203  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1141  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  47.37 
 
 
304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470867  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 
548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 
542 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.25 
 
 
585 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  40.84 
 
 
455 aa  200  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.16 
 
 
600 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.88 
 
 
1190 aa  200  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  44.96 
 
 
742 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.93 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.57 
 
 
833 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 
569 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0591  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
837 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.85194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  41.87 
 
 
564 aa  197  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.03 
 
 
828 aa  196  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
604 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
360 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  43.32 
 
 
571 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  39.28 
 
 
646 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.42 
 
 
599 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.92 
 
 
481 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.27 
 
 
716 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 
587 aa  194  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
652 aa  194  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.6 
 
 
1148 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.38 
 
 
751 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1866  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
551 aa  193  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  41.63 
 
 
696 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.14 
 
 
673 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
589 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.22 
 
 
898 aa  191  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
594 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 
638 aa  190  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.76 
 
 
557 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.03 
 
 
496 aa  190  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
550 aa  190  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
676 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  44.66 
 
 
616 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 
522 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
898 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
514 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.03 
 
 
687 aa  187  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
637 aa  187  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
603 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  43.31 
 
 
743 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2698  serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 
696 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.152894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2074  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.63 
 
 
617 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  45.17 
 
 
508 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.25 
 
 
520 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
771 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
611 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1299  serine/threonine protein kinase  42.12 
 
 
564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 
780 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.85 
 
 
814 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>