More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4047 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4047  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 		 916 aa  1776    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60.81 
 
 		 975 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.32 
 
 		 806 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.34 
 
 		 898 aa  202  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 		 721 aa  198  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 		 734 aa  195  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.76 
 
 		 641 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 421 aa  179  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.34 
 
 		 833 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.44 
 
 		 828 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.31 
 
 		 865 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.36 
 
 		 932 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 613 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.27 
 
 		 814 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.12 
 
 		 723 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 611 aa  170  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 		 455 aa  168  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 637 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 589 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 		 573 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 		 624 aa  166  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 		 520 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 		 780 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.02 
 
 		 729 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.81 
 
 		 557 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 		 547 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.37 
 
 		 687 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 594 aa  162  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 		 481 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.6 
 
 		 585 aa  161  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 		 590 aa  161  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 		 624 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 		 612 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.11 
 
 		 835 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  37.77 
 
 		 638 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 		 292 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  35.91 
 
 		 542 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.84 
 
 		 673 aa  159  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.85 
 
 		 599 aa  158  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 		 870 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 		 490 aa  158  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 587 aa  157  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 680 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 820 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  38.82 
 
 		 742 aa  156  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.69 
 
 		 481 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 716 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  36.68 
 
 		 586 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.71 
 
 		 1256 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 		 569 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 569 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.57 
 
 		 600 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 571 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 		 652 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2875  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 541 aa  154  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0446464  normal  0.277743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.77 
 
 		 496 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  36.83 
 
 		 646 aa  153  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  41.73 
 
 		 616 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 		 738 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  37.22 
 
 		 637 aa  152  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 		 771 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 528 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 		 608 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  35.36 
 
 		 644 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  38.58 
 
 		 676 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.55 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 603 aa  149  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  35.55 
 
 		 601 aa  149  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 597 aa  148  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 		 695 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.85 
 
 		 716 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  36.06 
 
 		 550 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 		 542 aa  147  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 560 aa  147  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 360 aa  146  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 632 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 		 694 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 352 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 608 aa  145  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 624 aa  145  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 		 754 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.15 
 
 		 587 aa  144  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.03 
 
 		 1194 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 		 514 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.46 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 696 aa  142  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.85 
 
 		 761 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  33.46 
 
 		 545 aa  141  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 544 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 		 644 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 		 526 aa  140  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.36 
 
 		 1148 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1302  serine/threonine protein kinase  37.41 
 
 		 589 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0592381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0360  serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 		 508 aa  140  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 		 637 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>