More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0669 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0669  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  100 
 
 
975 aa  1864    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0315888  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4047  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  60.81 
 
 
916 aa  320  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 
721 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 
734 aa  226  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.96 
 
 
641 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.08 
 
 
898 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.94 
 
 
865 aa  211  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.91 
 
 
806 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 
611 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1947  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.28 
 
 
932 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  0.992815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0406  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.61 
 
 
624 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.33 
 
 
833 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
573 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.7 
 
 
585 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.08 
 
 
723 aa  195  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.94 
 
 
828 aa  194  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 
680 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4425  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
613 aa  194  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.373285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  39.16 
 
 
455 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.11 
 
 
421 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4005  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
652 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599637  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  36.68 
 
 
569 aa  189  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  43.68 
 
 
520 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.15 
 
 
599 aa  188  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.15 
 
 
835 aa  187  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
608 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5934  serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 
550 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0503162  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  43.3 
 
 
637 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.63 
 
 
814 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
589 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
571 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.21 
 
 
729 aa  183  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
695 aa  183  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  40.86 
 
 
624 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0500  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
490 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
555 aa  181  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.38 
 
 
557 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  40.61 
 
 
535 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
820 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
569 aa  179  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 
716 aa  177  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
644 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2860  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
780 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.08 
 
 
716 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0093  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.08 
 
 
520 aa  176  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.7 
 
 
587 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  37.77 
 
 
360 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
612 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.91 
 
 
481 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 
481 aa  174  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 
646 aa  174  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5244  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
601 aa  175  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
644 aa  174  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
547 aa  174  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7434  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.5 
 
 
673 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
586 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0666  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
292 aa  172  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  0.126887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 
754 aa  172  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
594 aa  172  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  41.15 
 
 
624 aa  171  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  39.38 
 
 
352 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
522 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4168  serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
870 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 
551 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
771 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32580  protein kinase family protein  38.91 
 
 
637 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2000  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 
597 aa  167  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0547084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 
709 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 
528 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39 
 
 
608 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  38.08 
 
 
564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2614  serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 
590 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.25394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
603 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0650  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
548 aa  164  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0794789  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0144  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 
616 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161088  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.68 
 
 
673 aa  164  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 
542 aa  164  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2874  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
604 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.422639  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6716  serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 
696 aa  164  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5206  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.02 
 
 
687 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228236  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 
632 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3606  serine/threonine protein kinase  36.82 
 
 
637 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.299495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.23 
 
 
733 aa  162  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.6 
 
 
600 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
416 aa  161  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 
544 aa  160  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
676 aa  160  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  32.71 
 
 
651 aa  159  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
617 aa  159  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5479  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
870 aa  159  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.915288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
542 aa  158  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6447  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
514 aa  157  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0751813  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3185  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.13 
 
 
496 aa  157  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200139  normal  0.0794633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.91 
 
 
618 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
560 aa  157  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32590  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 
630 aa  156  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.92 
 
 
761 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2216  serine/threonine protein kinase  38.72 
 
 
620 aa  156  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000015062  decreased coverage  0.00000142315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2371  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
694 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0774186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0245  serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
623 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442956  normal  0.53946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>