22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4027 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4027  hypothetical protein  100 
 
 
773 aa  1402    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4169  hypothetical protein  90.82 
 
 
773 aa  1178    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.10155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4143  hypothetical protein  90.82 
 
 
773 aa  1153    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  54.37 
 
 
773 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.69 
 
 
632 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.63 
 
 
633 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0852  hypothetical protein  31.28 
 
 
633 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.91 
 
 
742 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  29.13 
 
 
926 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
1489 aa  54.7  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
1710 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0897  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.89 
 
 
633 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  26.14 
 
 
980 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2892  hypothetical protein  27.37 
 
 
562 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.35 
 
 
2073 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  31.53 
 
 
1058 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  33.33 
 
 
1704 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  35.23 
 
 
1081 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4695  hypothetical protein  35.29 
 
 
509 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.209571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  40.45 
 
 
759 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.49 
 
 
1919 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 
753 aa  44.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.61298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>