18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4169 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4027  hypothetical protein  90.82 
 
 
773 aa  1135    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.657369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4169  hypothetical protein  100 
 
 
773 aa  1400    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.10155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4143  hypothetical protein  97.93 
 
 
773 aa  1257    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0398  hypothetical protein  53.19 
 
 
773 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.9 
 
 
742 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0911  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.82 
 
 
632 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0440438  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
1489 aa  64.3  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
1710 aa  63.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0852  hypothetical protein  31.12 
 
 
633 aa  57.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0901  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.46 
 
 
633 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  27.93 
 
 
926 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1023  hypothetical protein  27.35 
 
 
980 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4695  hypothetical protein  37.33 
 
 
509 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.209571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  29.57 
 
 
1058 aa  48.5  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0897  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.46 
 
 
633 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2892  hypothetical protein  26.62 
 
 
562 aa  47.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  26.02 
 
 
1202 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1022  hypothetical protein  27.24 
 
 
804 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>