102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1376 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  51.83 
 
 		 1056 aa  998    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 1081 aa  2219    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  35.1 
 
 		 1068 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  30.93 
 
 		 1057 aa  452  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  30.93 
 
 		 1051 aa  449  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  31.28 
 
 		 1041 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  30.54 
 
 		 1066 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  32.23 
 
 		 1061 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  28.03 
 
 		 1008 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 		 1116 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1097 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  27.12 
 
 		 1125 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1100 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1129 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1077 aa  326  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1074 aa  325  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1074 aa  317  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1105 aa  300  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1071 aa  291  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1068 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1067 aa  206  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1052 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1066 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1071 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 1026 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1041 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.29 
 
 		 992 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.18 
 
 		 1012 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1053 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1125 aa  131  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1122 aa  126  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1069 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 1123 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1232 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  32.41 
 
 		 1010 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1176 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1007 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1075 aa  115  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1008 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1161 aa  113  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1008 aa  112  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 1114 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 1105 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.3 
 
 		 1195 aa  104  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  30.03 
 
 		 1194 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.73 
 
 		 1203 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1066 aa  102  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 1149 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1016 aa  101  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  27.85 
 
 		 1298 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1075 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 1105 aa  99  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1065 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1141 aa  98.2  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1120 aa  98.2  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1122 aa  98.2  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1126 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.36 
 
 		 511 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1196 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1206 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1162 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 993 aa  93.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.72 
 
 		 1001 aa  90.5  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.33 
 
 		 1162 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  23.1 
 
 		 979 aa  89.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  23.13 
 
 		 1037 aa  89.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1109 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1007 aa  89.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  23.57 
 
 		 986 aa  89  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1188 aa  88.6  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.77 
 
 		 994 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 1010 aa  85.5  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1167 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  25.63 
 
 		 997 aa  82.4  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  22.86 
 
 		 1210 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1153 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.26 
 
 		 972 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.05 
 
 		 1050 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1132 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1066 aa  75.5  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1194 aa  75.1  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 1123 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1124 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1257 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1173 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1054 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.77 
 
 		 966 aa  65.1  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 897 aa  65.1  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  21.7 
 
 		 1007 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1008 aa  60.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 888 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 793 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  25.12 
 
 		 719 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 1087 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29.23 
 
 		 848 aa  48.9  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 866 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  26.44 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 952 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1089 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>