98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01318 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  51.07 
 
 		 1081 aa  1000    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  100 
 
 		 1056 aa  2141    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  32.82 
 
 		 1068 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  32.97 
 
 		 1066 aa  472  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  31.12 
 
 		 1008 aa  466  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  33.82 
 
 		 1061 aa  466  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  31.16 
 
 		 1051 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  32.65 
 
 		 1041 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  31.18 
 
 		 1057 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  30.77 
 
 		 1116 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1097 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1100 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1129 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1074 aa  347  7e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.87 
 
 		 1125 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1077 aa  330  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1105 aa  316  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  28 
 
 		 1074 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1071 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1067 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1068 aa  194  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1071 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1066 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1052 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1075 aa  134  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1125 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1053 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.03 
 
 		 992 aa  129  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1026 aa  126  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1123 aa  124  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 991 aa  121  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1069 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  23.74 
 
 		 1195 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 1176 aa  111  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1075 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1232 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  25.51 
 
 		 1012 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.04 
 
 		 1203 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 1105 aa  105  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.66 
 
 		 1010 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1041 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1141 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  31.05 
 
 		 1298 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  28.49 
 
 		 511 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1153 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  23.96 
 
 		 1007 aa  100  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  23.62 
 
 		 1037 aa  97.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1016 aa  96.3  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1008 aa  95.5  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1149 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1161 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.73 
 
 		 1050 aa  92.8  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 1065 aa  93.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 1008 aa  93.2  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1105 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1162 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1122 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1120 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1122 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 1007 aa  89.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1054 aa  88.2  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1173 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1126 aa  88.2  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1066 aa  87.8  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1132 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 1188 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1167 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1066 aa  86.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 1206 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  24.34 
 
 		 979 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  25.71 
 
 		 1162 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 1114 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  28.61 
 
 		 1194 aa  85.1  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1010 aa  85.1  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  28.31 
 
 		 1210 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1109 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.29 
 
 		 994 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1196 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1123 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1257 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.1 
 
 		 1001 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1124 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.4 
 
 		 997 aa  69.3  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1194 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 993 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.55 
 
 		 1007 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  26.78 
 
 		 966 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.76 
 
 		 986 aa  62  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  21.83 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 888 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 897 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1008 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.1 
 
 		 655 aa  50.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  28.48 
 
 		 862 aa  50.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.23 
 
 		 714 aa  47  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 999 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 804 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 1004 aa  44.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>