99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2136 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1124 aa  2295    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 1153 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1173 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1206 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1176 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1232 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  29.16 
 
 		 1210 aa  347  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1196 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 1149 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 1105 aa  313  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1069 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1065 aa  303  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1123 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 1123 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1167 aa  290  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.55 
 
 		 1195 aa  287  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1125 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1162 aa  280  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1075 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1141 aa  268  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.42 
 
 		 1203 aa  257  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.35 
 
 		 1194 aa  238  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1122 aa  230  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1161 aa  224  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1132 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1194 aa  212  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.78 
 
 		 1162 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  33.8 
 
 		 511 aa  177  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1257 aa  172  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1075 aa  157  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 1114 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  32.35 
 
 		 1298 aa  144  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1041 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1105 aa  125  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.17 
 
 		 710 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 1188 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  29.6 
 
 		 986 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1067 aa  111  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  31.72 
 
 		 1125 aa  106  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  30.52 
 
 		 979 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1100 aa  102  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1068 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  31 
 
 		 1120 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1122 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1126 aa  97.8  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1109 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1052 aa  96.3  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1071 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1074 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1066 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.99 
 
 		 1010 aa  83.2  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  30.38 
 
 		 1056 aa  83.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  29.35 
 
 		 1081 aa  83.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1097 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1008 aa  82.4  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1008 aa  81.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.3 
 
 		 1050 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.52 
 
 		 1061 aa  75.5  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  26.76 
 
 		 992 aa  75.1  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1077 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1054 aa  73.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 991 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.66 
 
 		 966 aa  71.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1129 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1071 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1066 aa  69.3  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 1007 aa  67.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1074 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  27.81 
 
 		 1068 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1053 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  29.08 
 
 		 1037 aa  67  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 993 aa  65.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 1026 aa  64.3  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 972 aa  64.3  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1105 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 1116 aa  62.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  27.04 
 
 		 997 aa  62.4  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.07 
 
 		 1001 aa  62.4  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1007 aa  61.6  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 749 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.97 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.24 
 
 		 1066 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1016 aa  57  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 1010 aa  55.1  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 897 aa  55.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.62 
 
 		 1057 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.81 
 
 		 994 aa  53.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 1066 aa  52.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.86 
 
 		 859 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  23.99 
 
 		 782 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.17 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 888 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 798 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3321  hypothetical protein  31.73 
 
 		 563 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  27.86 
 
 		 905 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.76 
 
 		 1007 aa  45.8  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 871 aa  45.8  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 932 aa  45.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 804 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>