82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0900 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  100 
 
 
1194 aa  2454    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
1206 aa  312  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
1153 aa  300  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.55 
 
 
1173 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.74 
 
 
1203 aa  204  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
1124 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
1176 aa  192  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.06 
 
 
1210 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
1114 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  23.87 
 
 
1194 aa  180  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 
1105 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 
1123 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.14 
 
 
1162 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
1123 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
1232 aa  161  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
1149 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  23.63 
 
 
1125 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.44 
 
 
1161 aa  151  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 
1105 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  22.55 
 
 
1162 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
1167 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 
1065 aa  125  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.59 
 
 
1075 aa  115  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.15 
 
 
1069 aa  112  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.44 
 
 
1196 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 
1041 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  28.15 
 
 
511 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.42 
 
 
1141 aa  104  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  23.73 
 
 
1298 aa  103  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  29.61 
 
 
986 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.11 
 
 
1075 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
1188 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  29.55 
 
 
1195 aa  92  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.56 
 
 
1067 aa  88.2  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.71 
 
 
1122 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.39 
 
 
1132 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.16 
 
 
1257 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  29.05 
 
 
1068 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  23.03 
 
 
710 aa  78.2  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
866 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  26.26 
 
 
1071 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  22.18 
 
 
1071 aa  74.7  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
1008 aa  74.3  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  21.89 
 
 
1097 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  24.8 
 
 
1008 aa  72.4  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.15 
 
 
1125 aa  72.4  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.71 
 
 
1081 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  27.24 
 
 
1056 aa  66.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  21.07 
 
 
1129 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  23.5 
 
 
1122 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  23.5 
 
 
1120 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  23.5 
 
 
1126 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  22.47 
 
 
1053 aa  62  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  24.35 
 
 
1010 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  23.63 
 
 
1109 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
1016 aa  58.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.84 
 
 
1052 aa  58.5  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.74 
 
 
1061 aa  58.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  25.06 
 
 
992 aa  57  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 
1074 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.11 
 
 
1068 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  27.85 
 
 
872 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 
871 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  25.95 
 
 
997 aa  52.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.31 
 
 
1077 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 
749 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 
833 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.1 
 
 
1051 aa  49.7  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 
753 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
1026 aa  50.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 
805 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 
1007 aa  48.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 
1005 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  26.24 
 
 
1105 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  32.46 
 
 
979 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.31 
 
 
966 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  26.72 
 
 
814 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  21.88 
 
 
1074 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 
810 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
798 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3321  hypothetical protein  26.79 
 
 
563 aa  45.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  31.63 
 
 
995 aa  45.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>