250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3841 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  43.53 
 
 		 1129 aa  876    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1100 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  100 
 
 		 1105 aa  2239    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  35.42 
 
 		 1125 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1097 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  33.91 
 
 		 1041 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1074 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1077 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1074 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1071 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  29.56 
 
 		 1068 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  28.6 
 
 		 1056 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.86 
 
 		 1081 aa  297  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  27.6 
 
 		 1061 aa  297  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  26.95 
 
 		 1051 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  27.97 
 
 		 1057 aa  272  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  26.79 
 
 		 1116 aa  264  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.24 
 
 		 1066 aa  259  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.77 
 
 		 1008 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25 
 
 		 1071 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1066 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1068 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1052 aa  179  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1053 aa  178  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1067 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1125 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1075 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 1041 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1122 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 1206 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 1105 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1075 aa  95.9  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 1153 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1069 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1232 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 1123 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1132 aa  89  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1105 aa  87.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 1149 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  28.21 
 
 		 1210 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  28.01 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  21.59 
 
 		 1195 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1120 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1122 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1176 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1126 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.81 
 
 		 1203 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1109 aa  78.2  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 993 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1196 aa  77.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  28.76 
 
 		 1298 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1141 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1257 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 1065 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  21 
 
 		 1167 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.67 
 
 		 986 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.56 
 
 		 1162 aa  72  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  19.86 
 
 		 1008 aa  70.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1161 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 888 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.79 
 
 		 966 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  20.45 
 
 		 1008 aa  69.3  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 1123 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.4 
 
 		 1012 aa  67  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1007 aa  67  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 1114 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.85 
 
 		 1194 aa  65.1  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1020 aa  65.1  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 952 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1090 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 991 aa  63.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  21.35 
 
 		 1010 aa  63.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  21.47 
 
 		 992 aa  62.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 775 aa  62.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1034 aa  62.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 1123 aa  62  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.08 
 
 		 1001 aa  61.6  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1066 aa  61.6  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 833 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 791 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  22.54 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.37 
 
 		 997 aa  59.7  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1147 aa  59.7  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1162 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 931 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 1089 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1004 aa  58.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  31.51 
 
 		 1080 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  34.21 
 
 		 1043 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 1010 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 791 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 938 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 866 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 962 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 992 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 1124 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 999 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 757 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>