116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1549 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1065 aa  2155    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1069 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1162 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1232 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1123 aa  307  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1105 aa  305  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1173 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1124 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1153 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1075 aa  272  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 1123 aa  258  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1196 aa  257  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1132 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.01 
 
 		 1203 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1125 aa  251  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1141 aa  240  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.35 
 
 		 1194 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 1149 aa  233  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1122 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1161 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.86 
 
 		 1210 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  25.57 
 
 		 1195 aa  210  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1114 aa  205  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.54 
 
 		 1162 aa  202  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.09 
 
 		 986 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 1167 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 1105 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 1176 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1041 aa  174  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  31.16 
 
 		 1298 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  31.87 
 
 		 511 aa  151  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 1206 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  31.14 
 
 		 1257 aa  139  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1075 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  22.14 
 
 		 966 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1071 aa  129  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1066 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1194 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1053 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1074 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  29.15 
 
 		 1010 aa  110  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 1097 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.81 
 
 		 1125 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1067 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1052 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.89 
 
 		 1041 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1188 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  24.75 
 
 		 710 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1016 aa  98.6  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.67 
 
 		 992 aa  98.2  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1077 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.49 
 
 		 979 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1129 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1008 aa  91.3  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.43 
 
 		 1081 aa  90.9  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1008 aa  89.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  27.33 
 
 		 1056 aa  88.6  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28 
 
 		 1068 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1120 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1122 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1074 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1126 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 972 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1010 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 991 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1071 aa  79.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  27.35 
 
 		 1037 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1007 aa  77.4  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1100 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1105 aa  74.7  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 993 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1109 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 1026 aa  71.6  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1007 aa  70.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.92 
 
 		 1007 aa  70.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1066 aa  68.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1066 aa  67.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.02 
 
 		 1050 aa  67.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.95 
 
 		 1008 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 1054 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.83 
 
 		 1061 aa  66.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  27.04 
 
 		 1012 aa  65.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.88 
 
 		 1066 aa  65.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.73 
 
 		 1001 aa  59.3  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 897 aa  58.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  23.88 
 
 		 994 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  22.68 
 
 		 1057 aa  55.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 888 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  45.98 
 
 		 893 aa  54.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  20.98 
 
 		 1051 aa  53.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 749 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 952 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  23.67 
 
 		 1116 aa  50.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  22.86 
 
 		 822 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 935 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  27.03 
 
 		 746 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  27.03 
 
 		 746 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  27.03 
 
 		 746 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  27.03 
 
 		 746 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>