100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2685 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  49.66 
 
 		 1008 aa  981    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1026 aa  2127    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  48.98 
 
 		 1010 aa  972    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  48.15 
 
 		 1012 aa  855    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  43.76 
 
 		 992 aa  739    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  49.76 
 
 		 1008 aa  975    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 		 1016 aa  582  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1075 aa  158  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  24.72 
 
 		 1081 aa  147  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1052 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1041 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1123 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1097 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  25 
 
 		 1056 aa  122  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1071 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1068 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  24.44 
 
 		 1057 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.04 
 
 		 1061 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1007 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.8 
 
 		 1037 aa  111  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1075 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  28.53 
 
 		 1298 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.57 
 
 		 1008 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1071 aa  104  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1149 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  29.11 
 
 		 1195 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1125 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 1100 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1123 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1105 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1067 aa  101  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1077 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1074 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1176 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.54 
 
 		 1041 aa  98.6  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 1232 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1162 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.91 
 
 		 1051 aa  95.9  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  26.07 
 
 		 511 aa  95.5  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1066 aa  95.5  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.19 
 
 		 1203 aa  94.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1053 aa  94.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1167 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  21.96 
 
 		 972 aa  92  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1069 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1105 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1206 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  27.15 
 
 		 986 aa  87.8  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1173 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 993 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1257 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1161 aa  84.7  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.54 
 
 		 1074 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.57 
 
 		 1210 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 1114 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1129 aa  83.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.78 
 
 		 1001 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1153 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  22.89 
 
 		 979 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  23.99 
 
 		 1068 aa  77  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  22.41 
 
 		 1066 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.4 
 
 		 1162 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  22.47 
 
 		 1116 aa  75.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.28 
 
 		 1050 aa  74.7  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1132 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.97 
 
 		 1066 aa  73.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  21.35 
 
 		 1007 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.86 
 
 		 1194 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  25 
 
 		 966 aa  71.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1122 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 991 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1196 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.77 
 
 		 1125 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1010 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1007 aa  63.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.1 
 
 		 994 aa  62  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 1066 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1126 aa  58.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1054 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1122 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1120 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 1188 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1105 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1124 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 888 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  25 
 
 		 1008 aa  52  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.99 
 
 		 997 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 952 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 1089 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1194 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  28.65 
 
 		 485 aa  47.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 935 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  21.67 
 
 		 775 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1066 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 		 719 aa  45.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 753 aa  45.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>