91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00733 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  51.86 
 
 		 1051 aa  1118    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  100 
 
 		 1057 aa  2139    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  44.86 
 
 		 1008 aa  867    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  36.15 
 
 		 1066 aa  592  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  34.8 
 
 		 1061 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  33.51 
 
 		 1116 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  31.29 
 
 		 1081 aa  446  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  31.3 
 
 		 1056 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.41 
 
 		 1068 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  30.31 
 
 		 1041 aa  354  5e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1097 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1129 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1100 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1077 aa  274  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1105 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.05 
 
 		 1125 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1071 aa  262  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1074 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1074 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1052 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 993 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 1026 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 1041 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1068 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1053 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1075 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1007 aa  104  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1066 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 1066 aa  101  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1122 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  26.81 
 
 		 1010 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1071 aa  98.6  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 		 1007 aa  96.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.28 
 
 		 972 aa  95.1  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.67 
 
 		 979 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 1232 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 1176 aa  92  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1105 aa  91.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 1008 aa  91.7  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1125 aa  91.3  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1067 aa  90.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  25.2 
 
 		 992 aa  88.6  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1008 aa  87  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.39 
 
 		 1001 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 991 aa  85.5  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  27.81 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1016 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1109 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1122 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1126 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1120 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.5 
 
 		 997 aa  80.9  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 1105 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1075 aa  78.2  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 1114 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  24.64 
 
 		 1037 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  27.65 
 
 		 994 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1069 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.91 
 
 		 1050 aa  76.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1173 aa  75.1  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 1206 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1161 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 1123 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  24.39 
 
 		 1195 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1141 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  22.96 
 
 		 1012 aa  73.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26 
 
 		 1298 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1257 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 1167 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  22.14 
 
 		 986 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.92 
 
 		 1203 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 1188 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.23 
 
 		 1210 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1149 aa  66.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1162 aa  65.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25 
 
 		 1132 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1007 aa  63.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.21 
 
 		 966 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 1065 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 1123 aa  55.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1196 aa  55.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1054 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1010 aa  53.5  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1008 aa  51.6  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  22.54 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  21.9 
 
 		 680 aa  49.3  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 791 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 1153 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  22.08 
 
 		 1162 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  20 
 
 		 935 aa  45.8  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>