41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2574 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  100 
 
 
710 aa  1447    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  31 
 
 
1194 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
1176 aa  197  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
1153 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
1123 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  28.01 
 
 
1162 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  28.12 
 
 
1203 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.84 
 
 
1162 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  25.62 
 
 
1196 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.01 
 
 
1125 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.81 
 
 
1141 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
1124 aa  124  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  24.86 
 
 
1173 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.29 
 
 
1075 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  24.14 
 
 
1069 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 
1232 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25 
 
 
1132 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 
1065 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
1206 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 
1123 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.46 
 
 
1161 aa  94  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  29.96 
 
 
1257 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  24.76 
 
 
1195 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
1114 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25 
 
 
1105 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  29.78 
 
 
1298 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  24.26 
 
 
1210 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 
1105 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  23.03 
 
 
1194 aa  77.8  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
1149 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.11 
 
 
1122 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
1167 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.51 
 
 
1075 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  21.8 
 
 
986 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  32.77 
 
 
1061 aa  54.7  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
1016 aa  50.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 
1054 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 
781 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 
1066 aa  44.3  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  42.22 
 
 
781 aa  44.3  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.57 
 
 
1010 aa  44.3  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>