138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1501 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1123 aa  2287    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1176 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1162 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  30.64 
 
 		 1203 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1075 aa  382  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1105 aa  376  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1125 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1123 aa  363  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1149 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28.38 
 
 		 1195 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1153 aa  336  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  28.48 
 
 		 1194 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  28.11 
 
 		 1210 aa  321  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1141 aa  320  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1173 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1065 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1232 aa  303  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1196 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  27.77 
 
 		 1162 aa  293  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1124 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1132 aa  281  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1105 aa  263  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 1206 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 1114 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1161 aa  253  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1257 aa  234  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  27.61 
 
 		 1298 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1122 aa  196  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1075 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  35.87 
 
 		 511 aa  181  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1069 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 1041 aa  179  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 1167 aa  173  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  33.77 
 
 		 986 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1194 aa  166  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  28.77 
 
 		 710 aa  163  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1052 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 1188 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1071 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  30.3 
 
 		 1010 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 1016 aa  105  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1068 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1026 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1008 aa  99.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.51 
 
 		 992 aa  99  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1126 aa  98.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1008 aa  98.2  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1120 aa  98.6  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1122 aa  98.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.83 
 
 		 979 aa  98.2  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1053 aa  97.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1066 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 991 aa  95.5  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1067 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  26.13 
 
 		 966 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 888 aa  90.9  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  24.81 
 
 		 972 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1077 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 1010 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  29.17 
 
 		 1012 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  26.92 
 
 		 1037 aa  85.1  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  25.4 
 
 		 1068 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1097 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 1007 aa  77  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  26.54 
 
 		 1001 aa  77  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1109 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.28 
 
 		 1125 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1129 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.48 
 
 		 997 aa  74.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1074 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 993 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 935 aa  73.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  27.89 
 
 		 1061 aa  72.4  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.6 
 
 		 1056 aa  72  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1054 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1007 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.24 
 
 		 1050 aa  69.7  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 1116 aa  69.3  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1105 aa  68.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1007 aa  68.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1100 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  23.82 
 
 		 994 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 897 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1066 aa  65.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.23 
 
 		 1081 aa  63.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1066 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1089 aa  63.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.85 
 
 		 1066 aa  62  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1008 aa  61.2  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1066 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  26.09 
 
 		 788 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 871 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1074 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.32 
 
 		 1008 aa  58.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1043 aa  57.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1087 aa  55.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1079 aa  55.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.01 
 
 		 1057 aa  55.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>