104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02276 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  40.69 
 
 		 1037 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 1050 aa  2129    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  42.51 
 
 		 1007 aa  744    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1007 aa  396  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 993 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  28.88 
 
 		 1007 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  28.71 
 
 		 1001 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  27.36 
 
 		 972 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1066 aa  357  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  27.11 
 
 		 997 aa  321  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  27.21 
 
 		 994 aa  321  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 1066 aa  308  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 991 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  31.16 
 
 		 485 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1188 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 1041 aa  98.6  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1109 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.69 
 
 		 1010 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1206 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.05 
 
 		 1012 aa  91.3  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1120 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1122 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1105 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28.05 
 
 		 1195 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  23.68 
 
 		 1056 aa  88.6  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1126 aa  88.6  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1075 aa  88.6  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1054 aa  88.6  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1008 aa  88.2  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 1232 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 1008 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1075 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1149 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.43 
 
 		 992 aa  82  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1016 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  27.58 
 
 		 1210 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.28 
 
 		 1057 aa  78.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1176 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1068 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1123 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 1089 aa  77  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1052 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.98 
 
 		 1068 aa  75.5  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 1026 aa  75.5  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1067 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1141 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1053 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.47 
 
 		 979 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.83 
 
 		 986 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.96 
 
 		 1081 aa  72  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  21.5 
 
 		 1097 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1167 aa  71.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 1065 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1162 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  29.05 
 
 		 1298 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 1123 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1173 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1069 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1008 aa  69.3  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1071 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.68 
 
 		 1125 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 1087 aa  68.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1124 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1153 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.8 
 
 		 511 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1125 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1114 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 952 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1105 aa  65.1  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1010 aa  63.9  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 935 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1132 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1074 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1196 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1066 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 1100 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 1074 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  22.38 
 
 		 1194 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  22.86 
 
 		 1041 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 888 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  20.99 
 
 		 1051 aa  58.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.44 
 
 		 1066 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1077 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1257 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1122 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 1116 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1129 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 897 aa  53.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  24.46 
 
 		 966 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 813 aa  48.9  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.31 
 
 		 1203 aa  48.5  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  21.65 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  21.83 
 
 		 769 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.5 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  30.22 
 
 		 880 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 739 aa  46.2  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 925 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  29.17 
 
 		 618 aa  45.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  26.32 
 
 		 860 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>