90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0536 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  44.83 
 
 		 1051 aa  869    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  100 
 
 		 1008 aa  2044    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  44.86 
 
 		 1057 aa  870    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  34.1 
 
 		 1066 aa  515  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  31.39 
 
 		 1061 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  31.38 
 
 		 1056 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  28.92 
 
 		 1116 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.1 
 
 		 1081 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.45 
 
 		 1068 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  28.05 
 
 		 1041 aa  335  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1071 aa  270  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1077 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1097 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1074 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1129 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.62 
 
 		 1125 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1100 aa  234  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 1074 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1105 aa  227  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1068 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  22.99 
 
 		 1010 aa  109  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1071 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1122 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1053 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 993 aa  103  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1008 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 1026 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1008 aa  100  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1125 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1041 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1067 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1052 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1232 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1066 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.42 
 
 		 992 aa  85.5  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1016 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1075 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1075 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  24.32 
 
 		 1203 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  22.15 
 
 		 1195 aa  77.8  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 991 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 1123 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1132 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1069 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.44 
 
 		 972 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 1007 aa  73.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  23.62 
 
 		 1007 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1149 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 1176 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.52 
 
 		 1001 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1105 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1141 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  22.62 
 
 		 994 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.25 
 
 		 1210 aa  68.2  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1122 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1120 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1065 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1162 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1109 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1105 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.3 
 
 		 1162 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1126 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1173 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 1206 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1066 aa  62.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 1114 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.06 
 
 		 1012 aa  61.6  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  24.5 
 
 		 1298 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 1167 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 1188 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  22.59 
 
 		 997 aa  58.9  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  23.36 
 
 		 1037 aa  58.9  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1123 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  20 
 
 		 1161 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  23.87 
 
 		 986 aa  55.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.23 
 
 		 979 aa  54.7  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1066 aa  53.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1196 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.84 
 
 		 511 aa  51.6  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  21.25 
 
 		 1194 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1257 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  35.53 
 
 		 737 aa  48.5  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1008 aa  48.5  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  21.53 
 
 		 1054 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 828 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  29.57 
 
 		 807 aa  46.2  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 1153 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 1007 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.21 
 
 		 1050 aa  44.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  31.58 
 
 		 737 aa  44.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>