185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0292 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  100 
 
 
1122 aa  2288    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  88.3 
 
 
1126 aa  2015    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  57.25 
 
 
1109 aa  1251    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  98.83 
 
 
1120 aa  2235    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 
1054 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
991 aa  231  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
1007 aa  168  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 
972 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 
1066 aa  141  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
1066 aa  138  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 
1188 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
993 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  24.72 
 
 
1007 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 
888 aa  128  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  24.91 
 
 
485 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 
1105 aa  121  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  31.23 
 
 
1075 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  27.93 
 
 
1195 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.56 
 
 
1001 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
1176 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  29.7 
 
 
1141 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  28.15 
 
 
1203 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 
1007 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 
1041 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  25.87 
 
 
994 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.09 
 
 
1069 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  29.02 
 
 
1052 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 
1100 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 
897 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  29.48 
 
 
1037 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.03 
 
 
997 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.48 
 
 
1196 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.27 
 
 
1162 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 
935 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
1149 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  26.01 
 
 
1161 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 
1206 aa  99.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.54 
 
 
1125 aa  99  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
1123 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  28.71 
 
 
1298 aa  98.2  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
1167 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 
1087 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  29.72 
 
 
1074 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
1232 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.83 
 
 
1210 aa  95.1  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  28.53 
 
 
1194 aa  94  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.39 
 
 
986 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.7 
 
 
1068 aa  93.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
1105 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.01 
 
 
1075 aa  92.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
1114 aa  92  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 
952 aa  92  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.97 
 
 
511 aa  91.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  27.07 
 
 
1053 aa  91.3  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
966 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.3 
 
 
1050 aa  90.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
1153 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 
1089 aa  89.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 
1124 aa  88.6  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.94 
 
 
1081 aa  88.6  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
1065 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 
1074 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.12 
 
 
1071 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.03 
 
 
979 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  26.42 
 
 
1067 aa  85.5  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  27.57 
 
 
1056 aa  85.5  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.2 
 
 
1257 aa  85.1  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  26.23 
 
 
1008 aa  85.1  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.61 
 
 
1077 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
1123 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
1010 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.93 
 
 
1057 aa  82.4  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  24.73 
 
 
1125 aa  82.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.76 
 
 
1132 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.5 
 
 
1066 aa  81.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 
1097 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.9 
 
 
1071 aa  81.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.21 
 
 
1105 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  24.8 
 
 
1041 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  26.4 
 
 
1051 aa  79.7  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.55 
 
 
1068 aa  79.3  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.76 
 
 
1008 aa  78.6  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 
1008 aa  77.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  25.4 
 
 
1061 aa  77  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  26.07 
 
 
1066 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  28.48 
 
 
1122 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  29.39 
 
 
992 aa  71.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 
775 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 
1116 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.81 
 
 
1010 aa  71.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 
771 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  28.08 
 
 
791 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  25 
 
 
1173 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
814 aa  68.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  25.85 
 
 
1129 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.47 
 
 
1008 aa  67.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 
753 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  22.62 
 
 
1162 aa  62.4  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  25 
 
 
767 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 
1016 aa  59.7  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>