114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0143 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  100 
 
 		 1068 aa  2178    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  35.26 
 
 		 1081 aa  553  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  32.97 
 
 		 1056 aa  499  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  31.68 
 
 		 1041 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  29.46 
 
 		 1051 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  32.21 
 
 		 1061 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  31.28 
 
 		 1066 aa  381  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  29.97 
 
 		 1125 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  28.41 
 
 		 1057 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1097 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  28.26 
 
 		 1008 aa  348  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1105 aa  336  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  29 
 
 		 1116 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1100 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1129 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1074 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1077 aa  267  8.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1071 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1074 aa  257  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1068 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1071 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1041 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1069 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1052 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1132 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1122 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1125 aa  127  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  30.77 
 
 		 1298 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1075 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1075 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1232 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.14 
 
 		 986 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1176 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  23.01 
 
 		 992 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1053 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1067 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 1206 aa  104  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1008 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1161 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 1008 aa  102  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  28 
 
 		 511 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1105 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  26.67 
 
 		 1203 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 993 aa  99  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  25.6 
 
 		 1037 aa  98.6  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1066 aa  98.6  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1066 aa  98.2  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1141 aa  95.9  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1126 aa  94.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 1123 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 991 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1120 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1122 aa  93.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1196 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1257 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 1153 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.67 
 
 		 1194 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  23.76 
 
 		 997 aa  88.6  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  24.02 
 
 		 979 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1065 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  29.43 
 
 		 1195 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.4 
 
 		 1010 aa  87  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.83 
 
 		 1210 aa  85.5  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1167 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 1123 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 1188 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1173 aa  82.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  20.8 
 
 		 972 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 1007 aa  80.9  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  22.89 
 
 		 1162 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1149 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  22.24 
 
 		 994 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1066 aa  77.4  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 1105 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1114 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  22.52 
 
 		 1001 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1194 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1109 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 1026 aa  74.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1162 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.09 
 
 		 1050 aa  71.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 1016 aa  70.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.52 
 
 		 1007 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  22.62 
 
 		 1012 aa  70.1  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  22.53 
 
 		 1007 aa  68.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1008 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 1010 aa  61.6  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 897 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.83 
 
 		 966 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1124 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.19 
 
 		 655 aa  53.5  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 760 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 1004 aa  53.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 1090 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1198 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1089 aa  52  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1040 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 952 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1142 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>