177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4791 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  100 
 
 		 997 aa  2041    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  59.18 
 
 		 1001 aa  1189    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  72.4 
 
 		 994 aa  1466    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  39.16 
 
 		 993 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  31.5 
 
 		 972 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  31.87 
 
 		 1007 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1007 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1066 aa  353  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1066 aa  344  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1007 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.2 
 
 		 1050 aa  332  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  27.77 
 
 		 1037 aa  330  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 991 aa  324  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  34.66 
 
 		 485 aa  250  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1054 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1126 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1120 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1122 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1008 aa  101  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1109 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 1041 aa  97.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1176 aa  95.1  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  23.92 
 
 		 1068 aa  94.7  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1075 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.5 
 
 		 1057 aa  89.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  26.65 
 
 		 1081 aa  85.9  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1125 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1141 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 1232 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  25.98 
 
 		 1203 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 1188 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  24.45 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1123 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 1153 aa  78.2  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  21.06 
 
 		 986 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  22.51 
 
 		 1061 aa  74.7  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 1097 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1162 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  24.67 
 
 		 1298 aa  74.7  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  26.36 
 
 		 1194 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1196 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 1105 aa  72  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  26.94 
 
 		 1056 aa  71.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  21.27 
 
 		 992 aa  70.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1122 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1123 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1075 aa  69.7  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1068 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.85 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  23.96 
 
 		 1125 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  20.59 
 
 		 1010 aa  68.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1069 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  21.88 
 
 		 979 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1100 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 866 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1077 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 952 aa  66.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  22.61 
 
 		 1210 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  24 
 
 		 1053 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.84 
 
 		 1008 aa  65.1  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  22.94 
 
 		 1074 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 1008 aa  64.3  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1105 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1008 aa  64.3  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24 
 
 		 1052 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1071 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.33 
 
 		 1051 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  21.06 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 1206 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 1087 aa  63.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 828 aa  63.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1173 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.17 
 
 		 1116 aa  61.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1257 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 781 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  22.87 
 
 		 1162 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 1016 aa  60.1  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1067 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.79 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 888 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 1149 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 781 aa  57.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  23.64 
 
 		 1195 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 1089 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 730 aa  57  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 727 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 828 aa  56.2  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 743 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 836 aa  55.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 1124 aa  55.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 1105 aa  55.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1161 aa  54.7  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1071 aa  54.7  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1129 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 1114 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 790 aa  53.5  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>