153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4154 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1206 aa  2471    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 1153 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1173 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1124 aa  350  9e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 1232 aa  319  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  27.18 
 
 		 1210 aa  316  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1194 aa  308  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1196 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1141 aa  269  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1125 aa  262  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1123 aa  259  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1162 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  26.35 
 
 		 1195 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1123 aa  251  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1176 aa  245  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1167 aa  242  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.33 
 
 		 1194 aa  237  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 1149 aa  235  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1122 aa  234  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  26.35 
 
 		 1203 aa  232  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1069 aa  230  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1257 aa  227  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.31 
 
 		 1298 aa  207  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1105 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1132 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  31.61 
 
 		 511 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  25.02 
 
 		 1162 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1075 aa  162  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1161 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1075 aa  155  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 1114 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 1065 aa  149  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 1105 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1097 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  31.86 
 
 		 986 aa  132  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1188 aa  128  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 1041 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1067 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1071 aa  115  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  27.41 
 
 		 979 aa  111  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1100 aa  108  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1066 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.78 
 
 		 1068 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1126 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1052 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1068 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1120 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1053 aa  99.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1122 aa  99.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  26.06 
 
 		 710 aa  98.2  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1109 aa  97.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.91 
 
 		 1010 aa  97.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  27.86 
 
 		 1125 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1105 aa  96.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1008 aa  95.1  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.35 
 
 		 992 aa  94.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 1008 aa  93.6  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1129 aa  92.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1016 aa  90.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1066 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1077 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  27.45 
 
 		 1081 aa  89.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 991 aa  88.6  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.98 
 
 		 1050 aa  88.2  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  31.45 
 
 		 1037 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  27.76 
 
 		 1041 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  29.51 
 
 		 1056 aa  85.9  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1074 aa  84.7  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1074 aa  84.7  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 993 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1026 aa  84  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 1007 aa  81.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1010 aa  80.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  29.77 
 
 		 1012 aa  79  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  26.26 
 
 		 966 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  26.06 
 
 		 1061 aa  76.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 		 972 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1071 aa  74.7  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25.47 
 
 		 1057 aa  74.7  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 1066 aa  74.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 1116 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  24.43 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 897 aa  67.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 966 aa  65.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  22.71 
 
 		 1054 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 952 aa  65.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  21.89 
 
 		 1001 aa  64.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.92 
 
 		 1008 aa  63.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 888 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25 
 
 		 1066 aa  61.6  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 749 aa  61.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 871 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1007 aa  59.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 988 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  23.21 
 
 		 997 aa  58.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 935 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  25.13 
 
 		 782 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 793 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1102 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 753 aa  56.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>