128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0417 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1167 aa  2378    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  56.21 
 
 		 1195 aa  1246    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  57.61 
 
 		 1149 aa  1293    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1153 aa  329  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1125 aa  302  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1176 aa  301  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1161 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1123 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1105 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1075 aa  290  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1069 aa  281  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1132 aa  277  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 1124 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1173 aa  269  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1105 aa  268  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1206 aa  254  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1141 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.16 
 
 		 1203 aa  253  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 1114 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1162 aa  250  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1075 aa  249  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1122 aa  232  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.32 
 
 		 986 aa  225  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1196 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 1041 aa  211  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1257 aa  207  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 1065 aa  205  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  25.85 
 
 		 1194 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.46 
 
 		 1162 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.48 
 
 		 1298 aa  171  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.31 
 
 		 979 aa  170  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  34.56 
 
 		 511 aa  168  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 1123 aa  165  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 1232 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  35.26 
 
 		 1210 aa  155  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23.7 
 
 		 966 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1188 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1194 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1068 aa  121  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29 
 
 		 1071 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  22.84 
 
 		 1125 aa  112  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1008 aa  112  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1008 aa  111  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1067 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1052 aa  108  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1053 aa  106  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1129 aa  105  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  26.87 
 
 		 1010 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1120 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1122 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1066 aa  102  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1126 aa  101  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  23.27 
 
 		 1041 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  21.93 
 
 		 1100 aa  99.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1026 aa  97.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1074 aa  95.9  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1010 aa  95.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1097 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  29.45 
 
 		 1068 aa  93.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  29.11 
 
 		 1056 aa  94  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1077 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1109 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  31.53 
 
 		 992 aa  90.9  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1071 aa  89.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 1116 aa  89  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  25.08 
 
 		 1051 aa  88.6  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  27.24 
 
 		 1081 aa  87  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 991 aa  86.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1074 aa  85.1  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1066 aa  83.2  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 993 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.46 
 
 		 1061 aa  82  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1016 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.55 
 
 		 1066 aa  81.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1105 aa  81.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  28.78 
 
 		 1012 aa  81.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1066 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 972 aa  80.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  26.62 
 
 		 1057 aa  79  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.31 
 
 		 1050 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1007 aa  77.4  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 888 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 749 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.81 
 
 		 1008 aa  72.4  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.36 
 
 		 1037 aa  72.4  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  25.84 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 952 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 897 aa  69.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1054 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 1007 aa  67  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 871 aa  66.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 760 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  22.78 
 
 		 1007 aa  64.7  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 935 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 1087 aa  58.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1089 aa  53.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  21.43 
 
 		 791 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.49 
 
 		 1001 aa  52.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.39 
 
 		 797 aa  52.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  25.99 
 
 		 960 aa  51.6  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>