108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0423 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  100 
 
 		 1162 aa  2370    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 1123 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1176 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  30.57 
 
 		 1203 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 1232 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 1065 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 1123 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1141 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1196 aa  306  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1173 aa  291  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1075 aa  272  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1105 aa  268  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1132 aa  265  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.49 
 
 		 1162 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1153 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1206 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 1124 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 1149 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1125 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 1167 aa  243  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1161 aa  239  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 1105 aa  238  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1069 aa  230  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1114 aa  220  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.56 
 
 		 1194 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.25 
 
 		 1210 aa  211  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  30.7 
 
 		 511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.28 
 
 		 1298 aa  188  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1257 aa  175  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  33.8 
 
 		 1195 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1194 aa  160  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2574  hypothetical protein  28.01 
 
 		 710 aa  157  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1075 aa  141  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  28.4 
 
 		 986 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1122 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1041 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1071 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1068 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1066 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.77 
 
 		 992 aa  101  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  28.36 
 
 		 1010 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1053 aa  99  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1188 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1067 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1026 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1008 aa  93.2  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  29.31 
 
 		 1125 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.39 
 
 		 1081 aa  90.1  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  27.3 
 
 		 1056 aa  89.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1052 aa  89.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1008 aa  89  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1016 aa  88.6  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1066 aa  87.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  28.04 
 
 		 979 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.79 
 
 		 1066 aa  86.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1097 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1129 aa  85.5  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  31.37 
 
 		 1012 aa  84.7  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 1116 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 991 aa  83.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1100 aa  82.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1077 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  25 
 
 		 1051 aa  76.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1074 aa  76.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1074 aa  73.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  26.3 
 
 		 966 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  27.76 
 
 		 1068 aa  72.4  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.65 
 
 		 1007 aa  71.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  25.86 
 
 		 972 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  29.01 
 
 		 1041 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  24.5 
 
 		 1001 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  25.98 
 
 		 997 aa  68.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  23.17 
 
 		 1008 aa  67  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1109 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  24.02 
 
 		 994 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  26.17 
 
 		 1061 aa  65.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.68 
 
 		 1050 aa  65.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  25.07 
 
 		 1057 aa  65.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  27.08 
 
 		 1037 aa  63.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 888 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1126 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 749 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1120 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1122 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1071 aa  61.6  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1007 aa  61.6  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 1066 aa  60.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1105 aa  59.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 1010 aa  58.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 897 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1089 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 781 aa  52.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1008 aa  51.6  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 866 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 935 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  21.62 
 
 		 1054 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 781 aa  50.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 1007 aa  48.9  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>