112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0342 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1007 aa  2068    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  33.4 
 
 		 972 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  33.46 
 
 		 1007 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 993 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  29.36 
 
 		 997 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  29.38 
 
 		 1001 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  29.22 
 
 		 994 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1066 aa  396  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.68 
 
 		 1050 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 1007 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 1066 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 991 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  30 
 
 		 1037 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  32.41 
 
 		 485 aa  246  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1054 aa  175  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1109 aa  158  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 1041 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.17 
 
 		 992 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1008 aa  130  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1008 aa  125  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  24.5 
 
 		 1012 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.19 
 
 		 1081 aa  114  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1026 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1120 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1122 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1126 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  24.78 
 
 		 1057 aa  104  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1075 aa  101  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  23.89 
 
 		 1056 aa  98.6  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1105 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 1016 aa  92.8  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1149 aa  91.3  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1114 aa  90.9  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1097 aa  89.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 1176 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1232 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1188 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1071 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1069 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  28.66 
 
 		 511 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1123 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1105 aa  82.8  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.45 
 
 		 1061 aa  82.8  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1068 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  27.42 
 
 		 1162 aa  81.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  25.31 
 
 		 1195 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 1089 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1067 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  26.69 
 
 		 1298 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1129 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1008 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.39 
 
 		 1010 aa  78.2  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1075 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.65 
 
 		 1051 aa  77  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  23.17 
 
 		 986 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1053 aa  75.5  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1074 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1010 aa  74.7  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.03 
 
 		 1008 aa  72.8  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 888 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1066 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 1123 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1065 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1141 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 952 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1125 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1257 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1052 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  22.59 
 
 		 1041 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.53 
 
 		 1068 aa  68.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  20.78 
 
 		 1100 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1105 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 1116 aa  67  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1167 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1153 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  24 
 
 		 1077 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1196 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1162 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1122 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1132 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 833 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1206 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  24.38 
 
 		 979 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.43 
 
 		 1125 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.34 
 
 		 1066 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1087 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1074 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1147 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 865 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  24.34 
 
 		 1194 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1173 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  23.48 
 
 		 1203 aa  53.5  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 769 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1161 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 966 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 702 aa  52  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 935 aa  51.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  28.03 
 
 		 859 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>