More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4550 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  62.21 
 
 		 1182 aa  1518    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1192 aa  2430    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 823 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 810 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  38.77 
 
 		 381 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  26.51 
 
 		 822 aa  238  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  27.74 
 
 		 815 aa  234  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  28.82 
 
 		 897 aa  226  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  25.69 
 
 		 817 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  25.83 
 
 		 798 aa  204  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  24.76 
 
 		 801 aa  194  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  24.26 
 
 		 908 aa  161  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  24.43 
 
 		 918 aa  155  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  29.51 
 
 		 1411 aa  122  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  24.23 
 
 		 787 aa  110  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  30.12 
 
 		 409 aa  105  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1008 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  23.49 
 
 		 756 aa  91.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1177 aa  89.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1006 aa  88.6  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1152 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1132 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1124 aa  85.1  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 1004 aa  84.7  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 1140 aa  84.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 1163 aa  82.4  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  41.28 
 
 		 925 aa  82.4  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 1011 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  32.7 
 
 		 1030 aa  81.6  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  43.62 
 
 		 1051 aa  81.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1099 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1029 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1161 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1037 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  38.74 
 
 		 1119 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1028 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1019 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1079 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1177 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1153 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  40.38 
 
 		 997 aa  79  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1128 aa  78.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1142 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  37.82 
 
 		 1032 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 1094 aa  77.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1125 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 982 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 976 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 1166 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1023 aa  77.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1058 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1763  TonB-dependent receptor plug  45.74 
 
 		 170 aa  77.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.65 
 
 		 1071 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1059 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1097 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  40.2 
 
 		 1013 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1050 aa  76.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  36.42 
 
 		 1010 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1101 aa  76.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  41.35 
 
 		 1071 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  37.86 
 
 		 1021 aa  75.5  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1023 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 		 1172 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1147 aa  75.1  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1102 aa  75.1  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1043 aa  75.1  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1103 aa  75.1  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1127 aa  75.1  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  35.95 
 
 		 1035 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 1154 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1062 aa  74.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 1155 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  35.29 
 
 		 1065 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1059 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1038 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 1071 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 1211 aa  73.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1089 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 1025 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1060 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1129 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 1219 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  40.18 
 
 		 1109 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1038 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1077 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1079 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 988 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  42.72 
 
 		 1038 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1147 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 1010 aa  72.8  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1148 aa  72.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1092 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 1027 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  38.74 
 
 		 1022 aa  72.4  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1066 aa  72.4  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  37.17 
 
 		 1034 aa  72  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1122 aa  72  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 984 aa  72  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>