More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3771 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  43.14 
 
 		 823 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 810 aa  1672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  30.6 
 
 		 817 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  29.69 
 
 		 815 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  30.17 
 
 		 822 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  32.42 
 
 		 897 aa  314  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1182 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  28.12 
 
 		 801 aa  300  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1192 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  30.73 
 
 		 908 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  33.48 
 
 		 798 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  30.17 
 
 		 918 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  27 
 
 		 756 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  25.76 
 
 		 787 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  34.12 
 
 		 1411 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1166 aa  85.5  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  22.44 
 
 		 823 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 1012 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1047 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1105 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 1105 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  36.57 
 
 		 1023 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  40.83 
 
 		 1128 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  45.45 
 
 		 1065 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1011 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  41.53 
 
 		 1082 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  47.96 
 
 		 1124 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1064 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  45.26 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1147 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  47.62 
 
 		 1128 aa  71.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1093 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1095 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1103 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1003 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  44.12 
 
 		 1047 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1095 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  38.57 
 
 		 1148 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  35.81 
 
 		 1006 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  41.75 
 
 		 975 aa  69.3  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1189 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1763  TonB-dependent receptor plug  45.45 
 
 		 170 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1019 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 1086 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1059 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  43.43 
 
 		 989 aa  67.8  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 1063 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  35.56 
 
 		 993 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  36.42 
 
 		 1065 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  41.05 
 
 		 1106 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  44.79 
 
 		 1071 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  39.81 
 
 		 1148 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  37.68 
 
 		 1034 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  41.75 
 
 		 1039 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1043 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1139 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 1175 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1021 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1137 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 979 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 984 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  36.94 
 
 		 1115 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  46.81 
 
 		 1053 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1127 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1202 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  40.16 
 
 		 1034 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1013 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  42.11 
 
 		 1102 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1129 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1064 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  40.43 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  40.83 
 
 		 1102 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1132 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1096 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  46.32 
 
 		 1010 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 986 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  41.23 
 
 		 1094 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.85 
 
 		 1058 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 1014 aa  65.1  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  41.9 
 
 		 1164 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 1033 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1177 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1006 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1138 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1103 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1072 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.07 
 
 		 1059 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 1065 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  42.39 
 
 		 1154 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  40.62 
 
 		 1144 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1161 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  46.74 
 
 		 1042 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 1063 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1036 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1154 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1010 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1119 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1125 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1018 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  43.3 
 
 		 1116 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>