19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5019 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  100 
 
 		 815 aa  1679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  55.2 
 
 		 817 aa  957    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 810 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 823 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  27.94 
 
 		 822 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  30.42 
 
 		 897 aa  257  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1192 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  28.99 
 
 		 908 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  30.77 
 
 		 801 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1182 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  29.42 
 
 		 798 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  26.71 
 
 		 918 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  28.26 
 
 		 756 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  30.48 
 
 		 1411 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  25.73 
 
 		 787 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  33.83 
 
 		 823 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  38.32 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08741  hypothetical protein  27.64 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1138 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>