17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0719 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1602    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  41.72 
 
 
918 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  29.59 
 
 
897 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 
810 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  28.2 
 
 
822 aa  160  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 
823 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 
1192 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  24.1 
 
 
908 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  25.2 
 
 
801 aa  104  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 
1182 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  25.73 
 
 
815 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  42.11 
 
 
817 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  33.09 
 
 
798 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  30.07 
 
 
1411 aa  70.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  30.38 
 
 
756 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  28.38 
 
 
823 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  34.29 
 
 
575 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>