16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0554 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  100 
 
 
823 aa  1698    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  24.57 
 
 
1411 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  22.04 
 
 
918 aa  114  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  23.83 
 
 
897 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  23.43 
 
 
756 aa  104  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  19.96 
 
 
908 aa  88.6  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  22.44 
 
 
810 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  33.83 
 
 
815 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  22.67 
 
 
801 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  23.28 
 
 
817 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 
1192 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  21.62 
 
 
1182 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  27.08 
 
 
798 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  28.38 
 
 
787 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  30.57 
 
 
822 aa  60.8  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.229998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>