20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5846 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  100 
 
 		 817 aa  1681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  55.32 
 
 		 815 aa  955    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 810 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  30.29 
 
 		 822 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 823 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  32.42 
 
 		 897 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  26.22 
 
 		 801 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  26.98 
 
 		 798 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1192 aa  217  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  29.46 
 
 		 908 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1182 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  28.12 
 
 		 756 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  29.37 
 
 		 918 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  27.08 
 
 		 1411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  42.11 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  23.28 
 
 		 823 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  38.32 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 913 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 996 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08741  hypothetical protein  27.47 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>