More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0226 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  48.14 
 
 		 822 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  100 
 
 		 897 aa  1835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  36.74 
 
 		 908 aa  535  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  31.29 
 
 		 918 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 810 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 823 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  30.27 
 
 		 815 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  32.42 
 
 		 817 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  28.7 
 
 		 801 aa  240  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1192 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1182 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  28.01 
 
 		 798 aa  217  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  25.78 
 
 		 1411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  29.09 
 
 		 787 aa  187  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  23.59 
 
 		 823 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  24.38 
 
 		 756 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  47.87 
 
 		 1080 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.34 
 
 		 1023 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1161 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  34.86 
 
 		 1211 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  39.32 
 
 		 1049 aa  67.8  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1189 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1128 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  31.13 
 
 		 575 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 1181 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1043 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  38.32 
 
 		 1076 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  43.75 
 
 		 1017 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  37.68 
 
 		 1038 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1148 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  43.96 
 
 		 1060 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1164 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1018 aa  62.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1128 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  27.08 
 
 		 1002 aa  62  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1042 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  40.74 
 
 		 1229 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  43.69 
 
 		 1010 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1781  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1055 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  38.18 
 
 		 1018 aa  61.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 1000 aa  61.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 		 1047 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  43.06 
 
 		 1090 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  38.53 
 
 		 1154 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  41.49 
 
 		 1006 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 		 996 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  43.75 
 
 		 1102 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 996 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1979 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 1150 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  39.78 
 
 		 1019 aa  60.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  41 
 
 		 1063 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  41.24 
 
 		 1046 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1034 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  39.57 
 
 		 1005 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  42.05 
 
 		 1117 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 		 1172 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  39.58 
 
 		 1137 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1106 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1155 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 1036 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  38.78 
 
 		 1152 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  48.33 
 
 		 1155 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 		 1163 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1086 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 1062 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  37.11 
 
 		 1080 aa  58.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  36.73 
 
 		 1051 aa  58.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1168 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1110 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 1114 aa  58.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1119 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1023 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 1038 aa  58.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1023 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1041 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  39.13 
 
 		 1139 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  36.27 
 
 		 1202 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1006 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  39.78 
 
 		 1033 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 1050 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  35.61 
 
 		 1168 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  38.98 
 
 		 1039 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1103 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1028 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1051 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1041 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1059 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  38.83 
 
 		 1119 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  37.61 
 
 		 1007 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  49.25 
 
 		 1101 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  39.18 
 
 		 1079 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1181 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  39.8 
 
 		 1116 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  36.08 
 
 		 1014 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>