17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0469 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  100 
 
 
908 aa  1853    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  36.74 
 
 
897 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  33.48 
 
 
822 aa  343  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  33.39 
 
 
918 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 
810 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 
823 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  28.55 
 
 
815 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  29.15 
 
 
817 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 
1192 aa  172  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  25.64 
 
 
1411 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 
1182 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  30 
 
 
801 aa  148  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  30.42 
 
 
798 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  24.01 
 
 
787 aa  121  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  27.39 
 
 
756 aa  94.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  20.12 
 
 
823 aa  88.6  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08741  hypothetical protein  24.24 
 
 
558 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>