17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2372 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 918 aa  1884    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  41.72 
 
 		 787 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  31.29 
 
 		 897 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  33.39 
 
 		 908 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  29.19 
 
 		 822 aa  275  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 810 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 823 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  26.57 
 
 		 815 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1192 aa  164  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  25.81 
 
 		 1411 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1182 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  29.37 
 
 		 817 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  24.08 
 
 		 798 aa  139  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  26.37 
 
 		 801 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  29.57 
 
 		 756 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  22.02 
 
 		 823 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1434  hypothetical protein  25.79 
 
 		 575 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>